2016/7/23 の改訂で、関係ドメインの色指定を従来の3色から10色に大幅に拡充しました。「関係ドメイン一覧」から指定のドメイン名を選択すると「関係ドメイン情報」画面に来るので、ここで「関係ドメイン編集」選択します。そこで、色指定ができます。

Blue, Lime, Red, Yellow, Magenta, Aqua, Green, Orange, Pink, Gray  が選択可能です。